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本分局隸屬臺北市政府警察局(以下簡稱警察局),置分局長,承警察局局長之命綜理分局業務,並指揮監督所屬員工;置副分局長,襄理分局業務,並設6組3室10所2隊1中心,組織架構圖如下:

士林分局組織圖 分局長業務職掌;另開新視窗  副分局長業務職掌;另開新視窗  行政組業務職掌;另開新視窗  督察組業務職掌;另開新視窗  偵查隊業務職掌;另開新視窗  防治組業務職掌;另開新視窗  保防組業務職掌;另開新視窗  民防組業務職掌;另開新視窗  交通組業務職掌;另開新視窗  勤務指揮中心業務職掌;另開新視窗  秘書室業務職掌;另開新視窗  人事室業務職掌;另開新視窗  會計室業務職掌;另開新視窗  文林派出所業務職掌;另開新視窗  社子派出所業務職掌;另開新視窗  後港派出所業務職掌;另開新視窗  天母派出所業務職掌;另開新視窗  蘭雅派出所業務職掌;另開新視窗  芝山岩派出所業務職掌;另開新視窗  永福派出所業務職掌;另開新視窗  山仔后派出所業務職掌;另開新視窗  溪山派出所業務職掌;另開新視窗  翠山派出所業務職掌;另開新視窗  警備隊業務職掌;另開新視窗

本分局各單位職掌如下:
1.分局長:綜理分局業務,並指揮監督所屬員工。
2.副分局長:襄理分局業務。
3.行政組:勤務規劃督考、公共關係(含警友會)、正俗業務、志工團隊組訓運用、總務、駕駛工友管理及一般行政協助推行等事項。
4.督察組:勤務執行之督導考核、員警風紀維護、特種警衛與一般警衛派遣、集會遊行、秩序維護、保安警備措施規劃執行及警察常年教育訓練等事項。
5.防治組:警政婦幼安全業務、落實警勤區工作(家戶訪查、失蹤人口查尋通報處理、社區警政規劃執行)、警勤區劃分調整、協助主管機關對外國人、大 陸地區人民、港澳居民與臺灣地區無戶籍國民非法活動之調查處理及其他有關外事警察業務等事項。
6.保防組:機密保護、安全防護、保防教育、機關保防工作推行、觀光保防與社會保防工作推展、執行危害國家安全案件偵防作為、社會情報與治安調查工 作推行及其他有關安全偵防業務等事項。
7.民防組:義勇警察、民防團隊組訓與運用、防空疏散避難業務、災害防救業務、公私防空避難設備管理檢查與維護督導、全民防空(萬安)演習事宜及運 用民防人力協助警察勤務之規劃督導協調等事項。
8.交通組:交通管理規劃與交通秩序整理之督導執行、交通執法查察取締、道路施工交通管制會勘及其他交通業務等事項。
9.秘書室:文書、檔案、出納之管理與資訊、研考、員警心理輔導及諮商轉介等業務。
10.偵查隊:違反社會秩序維護法處理與行政處分、拾得物處理、拘留所管理、犯罪偵防、犯罪再犯機制策劃與執行、刑事案件偵訊與移送、婦幼刑案偵查、通緝犯查緝、 治安顧慮人口監管、刑案紀錄統計與資料分析運用、刑事現場勘察與痕跡蒐證、刑事鑑識、經濟警察業務、強化刑事責任區工作、不良幫派組合、組織犯罪檢肅及應受尿液採驗人採驗工作等事項。
11.勤務指揮中心:負責警察勤務之指揮、調度、協調、聯繫與最新治安狀況之通報管制、受理民眾與110通報案件之派遣、管制事項、組合巡邏警力派遣及聯繫等事 項。
12.警備隊:執行駐地安全、門禁 管制及各項臨時勤務。
13.文林派出所:負責仁勇里 、義信里、福德里、福林里、福志里、舊佳里、福佳里等轄內治安、交通事項。
14.社子派出所:負責富光里、福順里、葫蘆里、葫東里、社子里、社園里、社新里、永倫里、福安里、富洲里等轄內治安、交通事項。
15.後港派出所:負責後港里、前港里、百齡里、福中里、福華里、承德里、明勝里等轄內治安、交通事項。
16.天母派出所:負責三玉里、天祿里、天福里、天壽里、天玉里、天山里、天和里、天母里等轄內治安、交通事項。
17.蘭雅派出所:負責蘭雅里、忠誠里、蘭興里、德行里、德華里等轄內治安、交通事項。
18.芝山岩派出所:負責名山里、岩山里、聖山里、東山里、芝山里等轄內治安、交通事項。
19.永福派出所:負責新安里、永福里、公館里等轄內治安、交通事項。
20.山仔后派出所 :負責陽明里、菁山里等轄內治安、交通事項。
21.溪山派出所:負責溪山里、平等里等轄內治安、交通事項。
22.翠山派出所:負責翠山里、臨溪里等轄內治安、交通事項。
23.會計室:依法辦理歲計、會計及 統計事項。
24.人事室:依法辦理人事管理事項 。
25.交通分隊(交通警察大隊配賦):交通指揮疏導管制、稽查取締違規行為及事故處理、交通安全維護等各項工作。